水利工程监理甲级资质公司是负责监督、协调和管理水利工程建设过程中的专业机构。在进行水利工程监理工作时，公司主要需要关注以下几个方面的工作内容。

首先，公司需要对水利工程的施工过程进行全面监督和检查。这包括对施工进度、施工质量、施工方案的合理性等进行评估和监管，确保施工过程符合设计要求和相关法规标准。同时，要及时发现并解决施工中可能出现的问题，保障施工的顺利进行。

其次，公司需要进行水利工程的质量控制。这包括对施工过程中各项工作的质量进行把关，对材料的采购、验收，对施工单位的施工技术和质量管理进行监督和评估。同时，还需要定期进行工程的质量检查和评估，确保水利工程的质量符合设计要求和相关标准。

此外，公司还需进行水利工程的安全管理。水利工程往往涉及到水文、地质等复杂因素，存在一定的安全风险。因此，公司需要对施工现场和施工工艺进行全面安全评估和风险控制，确保施工过程中的安全。

最后，公司还需进行水利工程的环境保护。水利工程施工可能对周围环境造成一定影响，公司需对施工过程中的环境污染进行全面监测和控制，确保施工过程对环境的影响降到最低。

综上所述，水利工程监理甲级资质公司在进行工作时主要关注施工监督、质量控制、安全管理和环境保护等方面的工作内容。通过专业的监理服务，保障水利工程的顺利进行，并确保工程质量和安全。