水利工程监理公司可以建立定期和不定期的协商会办制度，以促进有效的沟通和合作，解决与项目相关的问题和难题。下面是一些建议的制度内容和运作方式：

1. 定期协商会办：

   - 定期时间：确定协商会办的周期，如每周、每月或每季度。

   - 参会成员：确定协商会办的参会成员，包括项目经理、监理工程师、技术人员等。

   - 议题确定：提前确定议题和议程，包括工程进展、质量问题、进度计划等。

   - 会议记录：安排专人记录会议内容，记录讨论、决策和行动项，保留会议记录。

2. 不定期协商会办：

   - 问题导向：根据需要，灵活安排不定期的协商会办，主要针对工程中出现的问题和需要解决的难题。

   - 参会成员：根据问题的性质和复杂程度，确定参会成员，包括相关专家、施工单位代表等。

   - 问题讨论和解决：深入讨论问题的原因和解决方案，确保问题及时得到解决，并确定后续的行动计划。

3. 会办运作方式：

   - 会议形式：可以选择线下会议或线上视频会议等方式进行协商会办，视实际情况和成员位置而定。

   - 信息共享：在会前提供相关的信息和材料，确保与会成员对问题和议题有所准备。

   - 讨论和决策：就议题逐一进行讨论和决策，让每个成员发表观点并达成一致意见。

   - 协商结果：确定行动项和责任人，确保问题的解决和后续工作的开展。

建立定期和不定期的协商会办制度可以促进监理公司与项目方、施工单位之间的沟通和合作，及时解决工程中出现的问题，确保工程质量和进度目标得以实现。同时，记录和归档会议内容和决策结果，便于后续追溯和跟踪工作进展。