水利甲级监理公司在监督水利工程施工过程中可能会发现各种问题和安全隐患。这些问题和隐患可能涉及工程质量、施工安全、环境保护等方面。以下是一些可能由水利甲级监理公司发现的问题和隐患的示例：

1. **地基处理不当：** 监理公司可能发现地基处理不当，包括地基沉降过大、地基稳定性不足等问题，可能会影响工程的安全和稳定性。

2. **施工质量不达标：** 可能发现施工过程中存在的质量问题，如墙体裂缝、结构不牢固、管道连接不密封等，这可能导致工程的使用寿命缩短或功能受损。

3. **安全隐患：** 监理公司可能发现施工现场存在的安全隐患，如高处作业不安全、施工区域没有合适的隔离措施、电气设备安全隐患等，可能会造成工人伤害或事故发生。

4. **环境污染：** 可能发现施工过程中对环境造成的污染问题，如废水排放超标、施工废料未及时清理等，可能会影响周围环境和生态系统。

5. **设计不合理：** 可能发现工程设计存在不合理或缺陷，如排水系统设计不畅、抗震设计不足等，可能会影响工程的功能和安全性。

6. **违规施工行为：** 可能发现施工单位存在违规行为，如超范围施工、擅自改变设计方案等，可能会导致工程质量和安全风险增加。

以上只是一些可能性的示例，实际监理过程中可能会出现更多不同类型的问题和隐患。水利甲级监理公司会根据发现的问题和隐患采取相应的措施，确保工程质量和安全达标。